目前，东京分行本部设有以下部门：业务发展部、金融市场部、国际结算部、个人金融部、风险管理部、财务管理部、收付清算部、综合管理部、信息科技部、合规部、稽核部、营业部等部门。此外，东京分行还下辖大阪分行、横滨分行、名古屋分行、东京大手町分行和神户分行。
